De houtafdeling beschikt over een modern machinepark met onder andere een C.N.C. gestuurde boor/freesmachine, een automatische kantenlijmmachine met retoursysteem en een computergestuurde platenzaagmachine. Op deze afdeling worden alle producten gemaakt. Volgens eigen ontwerp of op basis van een door een architect ontworpen tekening. De machines spelen in de productie een belangrijke rol, maar ook wordt een groot deel van de producten nog steeds handmatig gemaakt.
Ambachtelijk vakmanschap krijgt dus alle kans en is onder de medewerkers in ruime mate aanwezig. Groot voordeel is dat Weja hierdoor ook de meest complexe opdrachten kan uitvoeren en snel kan inspringen op onvoorziene situaties. Vooral als het gaat om verbouw komt de aanwezige kennis, ervaring en het vakmanschap van de medewerkers goed van pas.